Yoshi's Island DS est la suite de Super Mario World 2 : Yoshi's Island, et suit également Yoshi's Story et fait, comme ces derniers, parti de la série Yoshi. Comme il suit sa préquelle, il est chronologiquement le deuxième titre de la série Super Mario. Ce titre garde la palette graphique de sa préquelle, et fait apparaître de nouveaux bébés (Baby Donkey Kong et Baby Wario).